DIY为持续细胞造就带来高通量

网络整理 2019-04-16 15:01

“它答允我们跟踪数据,因为它累积,保留,我们可以查察任何判别率的数据时间线。它还将所有数据存储在处事器上,”他说。

该小组尽力寻找可以陈诉,记录和跟踪每个造就室中所有时间标准的所有变量的代码,但最终用最初设计用于跟踪股票价值的软件打造黄金。

Bashor暗示,他打算在本年秋天在会见相助者的辅佐下,在他本身的尝试室里在Rice的生物科学研究相助中制作一个更大的96腔eVOLVER版本。固然该设备不会用于他打算举办尝试的每个尝试中,但他正打算举办一些他最初为eVOLVER设想的合成生物学尝试。

“我们可以将合成电路放入电池中,然后我们可以进化电池,看看它们如何改变以适应电路,”他说。“来自热或饥饿等因素的压力可以对细胞发生压力进化,将合成电路放入细胞也可以起到压力浸染。细胞凡是不具备来自这些电路的基因,因此存在自然压力进化以挣脱它们。

莱斯大学的Caleb Bashor从未打算成为发现家或本身动手,但没有其他要领可以举办他所设想的微生物学尝试。

在该研究中描写的道理验证尝试中,研究人员利用eVOLVER在500小时内别离改变450多种酵母造就物中温度,造就基输入和​​输出以及情况的其他特征的程度和时间。传感器不绝陈诉每种造就物的表示,使研究人员可以或许评估特定酵母菌株对特定应激程度的适应水平。

“我知道本身动手做的电子文化,我一直在想,'必需有步伐让这个变得很是坚苦而且相对自制',”他说。“我开始存眷微节制器。我开始在网上查察电子产物目次和质料,我想,'好吧,我们可以利用哪些质料?'“我们怎么保持这么简朴?”

“我们正在研究的一件事是抗生素耐药性,”他回想说。“许多时候,当你一连服用这种药物时,抗生素耐药性呈现了。所以我在想,假如你用脉冲给药它会怎么样?脉冲有多长?你在那边看到抗生素耐药性进化?你在那边看到的不是进化?有没有步伐系统地看到抗生素打点的时间特征给你什么?

Bashor是一位练习有素的生物化学家和合成生物学家,他知道这种尝试不存在现成的设备,而且在高通量配置中组合尺度生物回响器将需要整个房间的空间而且耗费数十万美元。

“这个软件是一个挑战,”Bashor说。“我在MatLab中编写了一个小轮回来节制六种文化,更好的编码员从哪里开始对其举办具体叙述。实际上代码变得很是复杂。”

该项目最早的相助者是研究配相助者,BU的生物工程助理传授Ahmad“Mo”Khalil和Khalil团体的研究生Brandon Wong。三位和其他相助者一起在业余时间为eVOLVER事情,设计电子,流体,造就室和软件,既节制每个室又陈诉功效。

Rice的生物工程助理传授Bashor三年前在BU接受博士后研究员时首次想到了eVOLVER的想法。

“可是有些电池大概会成长出一种保持电路的方法,我们想知道他们是如何做到这一点的。这将是我们但愿可以或许设计的。”

他说:“我们的想法是让它变得自制,开源,完全可定制,这样任何人只要可以或许会识趣器车间,3D打印机和McMaster-Carr目次或RadioShack目次就可以制造它。”

Bashor暗示,新报纸中描写的eVOLVER原型16腔版本价值不到2000美元,比尝试室大概为单个持续造就生物回响器付出的价值自制。eVOLVER包罗三个模块:可定制的“智能套管”外壳和每个造就皿的接口,一个节制液体收支每个造就皿的流体模块,以及模块化硬件基本设施,简化了大批量的双向数据畅通过将每个参数疏散到各个微节制器中。

DIY为持续细胞造就带来高通量

“假如你打算一个时间课程说'我想每15分钟做一次,我想每小时做一次',等等,你很快意识到没有自动化是不行能的,”他说。“更不消说抗生素耐药性常常呈此刻几周而不是几天的时间范畴内。你需要可以或许运行几周的自动化措施,有数十或数百个单独节制和监测的样品。”

本周在线颁发的一篇论文和7月份的自然生物技能杂志封面上,来自波士顿大学(BU)和麻省理工学院的Bashor及其同事推出了eVOLVER系统,该系统团结了自动化细胞造就系统的节制本领。跟着高吞吐量系统的局限持续运行数月,同时增加了数十种文化。

本文相关资讯
体检功效造假担何责?

体检功效造假担何责?

如今,越来越多的人选择按期体检,不罕用人单元也会每年为员工布置体检。然而,最近某民营体检机构认真人提到,有...

哈佛生物学家方才展示了最遍及的基

哈佛生物学家方才展示了最遍及的基

哈佛医学院的研究人员从基础上改写了大肠杆菌细菌的基因组。该团队代替了其64个暗码子中的7个(3个字母的序列,凡是对...

青岛妇女儿童医院药师进校园 普及安

青岛妇女儿童医院药师进校园 普及安

信网12月27日讯 12月26日下午,青岛市妇女儿童医院药学部主任闫美兴总药师教育几名药师,来到青岛第53中小学部,给孩子...

较量真菌排泄物展现碳化合物降解途

较量真菌排泄物展现碳化合物降解途

它们不起眼的外表大概会使它们被自然栖息地中的植物或动物所掩盖,但真菌在维持其生态系统方面发挥着要害浸染。从...

更多