与尝试室对比细菌在人体中的表示如何

网络整理 2019-04-18 23:04

研究人员还包罗以前颁发的Whiteley尝试室和其他研究团队的体外和小鼠尝试数据。数据阐明技能包罗称为支持向量机的呆板进修要领,其用于区分取自人和体外来历的样品的基因表达谱。

“这项研究的要害点在于,此刻微生物学家可以对一系列人类传染的细菌群体举办转录组学研究,因此我们可以更好地相识细菌在这些临床传染中的实际浸染,”Cornforth说。“我们还可以确定我们的尝试室模子在那边乐成以及它们在仿照这些传染情况方面失败的处所。”

该研究获得了美国国立卫生研究院,囊性纤维化基金会和伦德贝克基金会的支持。除佐治亚理工学院的研究人员外,该研究团队还包罗德克萨斯理工大学康健科学中心,密西西比大学医学中心,加州大学以及丹麦的几个临床和研究机构的科学家。

铜绿假单胞菌是一种威胁免疫成果低下者的重要病原体,包罗患有囊性纤维化,糖尿病和肥胖症的人。这是一种主要的医院得到性传染,疾病节制和防范中心将多种耐药性细菌菌株定性为严重威胁。

我们本日所相识的关于铜绿假单胞菌等致命细菌的大大都都是从尝试室情况中举办的研究中得到的。5月14日在美国国度科学院院刊上颁发的研究陈诉显示,这些基于尝试室的信息大概对预测这些虫子入侵人类后的行为方法有重要限制。

在他们的研究中,科学家阐明白人类临床传染和尝试室尝试的RNA测序数据。人体样原来自相助的临床大夫,他们直接从患者身上取样并将其放入生存RNA的化学物质中以备后续处理惩罚。尝试室尝试在各类发展条件下研究了差异的细菌菌株,从抗生素处理惩罚到与其他细菌的竞争。

与尝试室对比细菌在人体中的表示如何

通过确定与尺度尝试室配置对比,细菌在人体中的表示如何差异,该事情可为更多样本和差异范例的传染举办特别研究奠基基本。

“领略哪些抗生素抗性基因在人体中高度表达大概会为我们关于抗生素利用的治疗决定提供信息,”怀特利说道,他在佐治亚理工学院接受分子和细胞生物学的Bennie H.和Nelson D. Abell主席,而且是乔治亚研究同盟。精巧的学者。“譬喻,人们大概会预测传染群体对基因表达数据的抗生素耐药性,而无需在临床尝试室造就微生物。”

固然这项研究只针对一个贫苦的病原体,但怀特利认为功效大概会发生更遍及的影响。“我们实际上对人类传染进程中的细菌行为知之甚少,并且大大都模子系统无法复制人类传染的大大都方面。我但愿这项事情可以推广到其他细菌。”

个中的差别是导致抗生素抗性的基因表达增加,这是今朝用于治疗多种传染的药物的祸殃。这项新研究可以辅佐科学家相识如何从他们的尝试室事情中得出更精确的结论- 并为大夫提供更好的治疗细菌传染的信息。

“我们看到了一些因抗生素抗性而污名昭着的基因的高表达,包罗编码从细胞中挤出抗生素的外排泵的基因以及降解某些抗生素的酶,如氨苄西林,”Whiteley尝试室研究科学家Daniel Cornforth说。这篇论文的第一作者。“研究抗生素耐药基因的研究也较少,个中三项与锌转运相关,我们之前的事情已确定为要害的抗生素耐药抉择因素,这些因素也在人类患者中高度表达。”

“人类传染的细菌往往可以或许耐受抗生素,但当我们将它们造就在人体外时,它们很是容易受到传染,”佐治亚理工学院生物科学学院传授,​​埃默里连系主任马文·怀特利说。 -Children的囊性纤维化中心。“在本文中,我们发明,与我们的尝试室和小鼠建模系统对比,几种反抗生素耐受性很重要的基因在人体中高度诱导。人类好像有一些奇特的促进抗性的因素。”

大概导致这种差此外原因仍然是个谜,尽量已知细菌会受到情况的影响。相识细菌基因及其表达程度在人类中的差别可以让研究人员寻找更好地模仿人类条件的尝试室条件,并为利用抗生素提供更好的指导。

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