蠕虫图谱描写了动物中每种细胞范例的基因读数

网络整理 2019-06-03 14:29

他估量像他的团队建造的那样的舆图集将激发关于细胞从头分类的剧烈辩说。

该项目标资深科学家是罗伯特沃特斯顿,华盛顿大学医学院基因组科学系传授和主席;Cole Trapnell,威斯康星大学基因组科学助理传授;和Jay Shendure,华盛顿大学基因组科学传授和Howard Hughes医学研究所的研究员。首席科学家是威斯康星大学医学院的研究生Junyue Cao和Jonathan Packer。

科学家们已经在Gene Expression Omnibus上为其他尝试室提供了原始数据,并提供了如何通过Jupyter Notebook处理惩罚数据的在线示例。

该研究颁发在“科学”杂志上。

他说,这项研究还表白,“神经细胞[处理惩罚和通报信息的神经细胞]是何等令人难以置信的特征。有一些稀有的神经细胞范例只由蠕虫中的一个或细胞代表。”

直到最近,还没有步伐按照基因勾当对生物体内的所有细胞举办全面分类。已经开拓了用于研究个别细胞中的基因活性的要领。

“我们此刻可以通过尝试对数万个细胞举办尝试,”Trapnell说。

他们的单细胞组合索引RNA测序要领或简称sci-RNA-seq的利益是速度快。可以在两天内由一小我私家完成每个尝试阐明数万个单细胞的转录组的文库。每个单位的本钱从3美分到20美分不等。

至于雷同尝试的预测,以得到可较量的小鼠某人体图谱,Trapnell暗示,在索引计策中,障碍不是那么多,而是在得到样本时。小鼠和人类不含有预定命量的细胞。另外,剖解学上处理惩罚整个巨大的生物体以收集所有范例的细胞也将是一个挑战。

蠕虫图谱描写了动物中每种细胞范例的基因读数

研究人员写道,他们认为他们的数据是一个舆图集的起点,该舆图集成立在由英国的约翰·苏尔斯顿(John Sulston)建设的得到诺贝尔奖的线虫舆图上,而且表白每个细胞在整个生命周期中的分子状态。这个重要的线虫。

研究人员预计,研究人员最终可以在一次尝试中阐明高出1000万个细胞的转录组。

该研究小组奇特地标志了很多细胞或其细胞核的完整基因读数。焦点充当细胞的中央打点办公室。

华盛顿大学的医学研究人员但愿缔造一种资源,以相识同一生物体内遍及细胞种类背后的原因。他们设计了对大量单细胞和单分子举办条形码编码和索引的计策。他们的方针是丈量蛔虫中每个细胞和细胞范例的分子状态。

遗传读数显示细胞通过RNA复制哪些DNA片断。RNA拷贝或转录物的荟萃称为转录组。它们成为卵白质出产或其他细胞勾当的偏向。

“我们的但愿是,这种资源将明显加快生物学家尽力展现关于动物如何形成和成长的新根基原则,”Trapnell说,“而且蠕虫中的这项事情成为更好地领略人类成长的踏脚石。

险些所有个别细胞都含有沟通的基因。这组基因是在受精时确定的,其时个别只是一个细胞。沿着多个细胞破裂的途径,身体最终由差异的细胞范例构成。

研究人员从技能节制开始,看看他们是否可以迅速将人类与小鼠细胞分隔。

这种线虫也有相对较少的细胞。在其幼虫阶段,它确切地说是762,不包罗生殖细胞。与很多其他动物差异,每个线虫幼虫具有沟通数量的细胞。

研究人员将他们的阐明计接应用于线虫Caenorhabditis elegans的幼虫阶段。这种蛔虫已经成为独一具有所有细胞和细胞范例的多细胞生物,以及这些细胞的整个发育谱系,已被记录在案。

它也是一种风行的遗传研究蠕虫,用于研究生命在受孕后如何开始形成,然后发展并通过生命阶段到暮年。

他们继承在一次尝试中首次丈量整个动物的所有细胞中的所有基因。

他说,将来的研究大概会研究动物发展进程中全动物转录组的变革,以及节制这些变革的因素,因为科学家们在一系列发育阶段举办这种范例的尝试。

蛔虫在动物的各类细胞中首次编辑基因读数。譬喻,在蠕虫生命的特定阶段拍摄的读数展现了每个细胞中哪些基因被打开或封锁。

每种细胞范例都有本身的选择性激活个别遗传暗码的部门。这些基因封锁/基因模式在很洪流平上表明白人体或动物体内很多特化细胞的无数形状,特性和成果。

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