向日葵基因组序列为更具弹性的作物提供蹊径图

网络整理 2019-06-20 10:03

“这将极大地促进我们的事情,以相识与非生物胁迫抗性相关的要害性状的分子机制 - 如干旱,盐度和低营养抗性,”伯克说。“这个基因组序列根基上可以作为一个遗传蹊径图来确定这些特征背后的基因。”

“作为向日葵基因组的第一个参考序列,它取得了相当大的成绩,”该论文的配相助者,植物生物学传授,UGA植物中心成员John M. Burke说。“向日葵基因组比玉米[玉米]基因组大40%以上,比人类基因组大20%阁下,其高度反复性使其成为组装的奇特挑战。”

作者得出结论,这项研究强化了向日葵作为生态和进化研究以及气候变革适应的模子,并将加快育种打算。

伯克的尝试室研究了向日葵家属内进化分歧的基因组基本,参加了基因组装配所依据的遗传图谱,并监视了本文所述的80个向日葵品系的全基因组从头测序。

向日葵以其瑰丽和重要的食物来历而闻名,是一种全球性的油料作物,有望应对气候变革,因为它可以在各类情况条件下保持不变的产量,包罗干旱。然而,直到最近组装向日葵基因组一直很坚苦,因为它主要由高度相似的相关序列构成。

乔治亚大学的研究人员是一个国际团队的一部门,该团队宣布了第一个向日葵基因组序这一新资源将有助于利用遗传东西改进作物规复力和石油出产的将来研究打算。他们本日颁发他们的研究成就在期刊自然。

向日葵基因组序列为更具弹性的作物提供蹊径图

国际相助由法国图卢兹法国国度农业研究所的Nicolas Langlade率领,个中包罗不列颠哥伦比亚大学的Loren Rieseberg。

“与很多植物基因组一样,向日葵基因组具有高度反复性,但在这种环境下,环境会更糟,”伯克说。“基因组中的反复元素最近才呈现,这意味着它们没有时间举办区分。因此,它就像构成一个庞大的谜题,个中很多部门看起来完全沟通,或险些沟通。”

他们确定了新的候选基因和重建的节制着花时间和油代谢的遗传网络,这是两个主要的向日葵繁殖特性,并发明着花时间网络已经被已往的整个基因组反复所塑造。他们的研究功效表白,古代的基因拷贝可以保存其成果,并在数千万年后仍然影响着感乐趣的特征。

北美和欧洲的研究小组对驯化向日葵Helianthus annuus L的基因组举办了测序。他们还举办了较量和全基因组阐明,这些阐明提供了对Asterids进化汗青的看法,Asterids是一种着花植物的亚群,包罗土豆,西红柿和咖啡。

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