第一个微生物专家来自数千篇论文

网络整理 2019-06-23 15:11

在他们的研究进程中,科学家们必需降服版权所带来的各类挑战,正式涵盖他们为事情目标所需的险些所有文件。在这一点上,他们面对着一个相当抵牾的问题 - 固然科学文献中出书的数据的易于会见和反复利用获得普遍支持和强烈敦促,可是通用版权实践使得科学家在将先前编译的数据归并到本身的数据时很难有信心。事情。作者接头了英国版权法的最新变革,这些变革使他们的事情可以或许看到光亮的一天。因此,他们将其输出作为事实提供,并利用Creative Commons的CC0宽免将其分派到民众​​规模,以使任何人无忧无虑地反复利用。

“我们存心选择文献的一个小节(限于一个期刊)来淘汰体积,速度和变革,主要会合在有效性上。我们要问,从半布局化科学文献中提取数据的高通量呆板是否可行和有代价。 “

“我们相信呆板此刻必不行少,使我们可以或许领略已颁发科学的流程,本文还接头了实现这一方针所固有的几个要害问题。”

系统地下载了可追溯到2003年1月的11年篇文章,以便提取系统发育树形图的所有图像文件举办阐明。然后,计较机视觉技能答允将图像自动转换回可反复利用的,可计较的系统发育数据,并用于所有证据的正式超树合成。

第一个微生物专家来自数千篇论文

在他们的研究中,研究人员选择了国际系统学和进化微生物学杂志(IJSEM) - 独一一个托管所有新的有效描写的原核分类群的存储库,因此,它是测试自动和半自动合成系统的最佳选择。已颁发的系统发育。据作者称,IJSEM每年宣布的系统发育树图像数量高出任何其他期刊。

固然最近的陈诉显示存在高出114,000,000份已颁发的科学文献的文件,但找到一种要领来改进对这种常识的获取并有效地综合它成为一个日益紧要的问题。

“我们此刻处于这样一个阶段:没有人有时间阅读所有已颁发论文的标题,更不消说摘要了,”作者评论道。

为了办理这个问题,英国科学家Ross Mounce和剑桥大学的Peter Murray-Rust以及巴斯大学的Matthew Wills利用发布的人物图像中的呆板专门提取的数据举办了世界上第一次自动化超等修建的实验。他们的研究功效颁发在开放科学期刊Research Ideas and Outcomes(RIO)上。

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